2005年6月，教育部“援疆学科建设计划”正式启动，为深化对口支援工作，优化新疆高校学科结构，促进学科建设，加快新疆高等教育内涵发展，提高新疆高等教育质量，教育部决定实施“援疆学科建设计划”，作为教育部为落实西部大开发战略而采取的一项重要举措，以清华大学、北京大学等中央部属高校为主体的国内40所重点高校对口支援新疆大学、新疆农业大学、塔里木大学、石河子大学、新疆医科大学等11所高校的82个一级学科建设。