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- 链接标题:基因数据处理123之SSW代码不正确,到时比SparkSW时间长_ssw比对-CSDN博客
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文章浏览阅读679次。更多代码请见:https://github.com/xubo245基因数据处理系列1.解释由于要生成新的score matrix:blosum50,第一次使用静态方法,直接传给align,到时每次运行都需要进行一次score matrix的计算,而这个是将blosum50的矩阵转换成128*128的矩阵,当计算Q0,即8个字符串的query时,显然时间占比大,本来序列比对时间就不长..._ssw比对
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